Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Hecw2Q6I6G8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Hecw2Q6I6G8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Hecw2Q6I6G8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Hecw2Q6I6G8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Hecw2Q6I6G8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Hecw2Q6I6G8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Hecw2Q6I6G8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Hecw2Q6I6G8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Hecw2Q6I6G8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Hecw2Q6I6G8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Hecw2Q6I6G8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Hecw2Q6I6G8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Hecw2Q6I6G8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Hecw2Q6I6G8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Hecw2Q6I6G8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Hecw2Q6I6G8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Hecw2Q6I6G8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
Hecw2Q6I6G8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Hecw2Q6I6G8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Hecw2Q6I6G8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Hecw2Q6I6G8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Hecw2Q6I6G8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Hecw2Q6I6G8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Hecw2Q6I6G8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Hecw2Q6I6G8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Hecw2Q6I6G8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Hecw2Q6I6G8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Hecw2Q6I6G8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Hecw2Q6I6G8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Hecw2Q6I6G8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Hecw2Q6I6G8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Hecw2Q6I6G8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Hecw2Q6I6G8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Hecw2Q6I6G8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Hecw2Q6I6G8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Hecw2Q6I6G8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Hecw2Q6I6G8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Hecw2Q6I6G8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Hecw2Q6I6G8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Hecw2Q6I6G8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Hecw2Q6I6G8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Hecw2Q6I6G8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Hecw2Q6I6G8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Hecw2Q6I6G8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Hecw2Q6I6G8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Hecw2Q6I6G8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Hecw2Q6I6G8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Hecw2Q6I6G8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Hecw2Q6I6G8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Hecw2Q6I6G8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Hecw2Q6I6G8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Hecw2Q6I6G8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Hecw2Q6I6G8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Hecw2Q6I6G8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Hecw2Q6I6G8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Hecw2Q6I6G8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Hecw2Q6I6G8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Hecw2Q6I6G8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Hecw2Q6I6G8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Hecw2Q6I6G8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms