Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ddx11Q6AXC6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ddx11Q6AXC6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddx11Q6AXC6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddx11Q6AXC6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddx11Q6AXC6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddx11Q6AXC6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddx11Q6AXC6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddx11Q6AXC6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddx11Q6AXC6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx11Q6AXC6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ddx11Q6AXC6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddx11Q6AXC6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddx11Q6AXC6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ddx11Q6AXC6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ddx11Q6AXC6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ddx11Q6AXC6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ddx11Q6AXC6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ddx11Q6AXC6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddx11Q6AXC6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms