Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZX8

Ablim3, Actin-binding LIM protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ablim3Q69ZX8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ablim3Q69ZX8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ablim3Q69ZX8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ablim3Q69ZX8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ablim3Q69ZX8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ablim3Q69ZX8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ablim3Q69ZX8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ablim3Q69ZX8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ablim3Q69ZX8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ablim3Q69ZX8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ablim3Q69ZX8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms