Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrcc1Q69ZB0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrcc1Q69ZB0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lrrcc1Q69ZB0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms