Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atg9aQ68FE2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atg9aQ68FE2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atg9aQ68FE2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg9aQ68FE2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg9aQ68FE2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg9aQ68FE2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg9aQ68FE2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg9aQ68FE2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg9aQ68FE2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg9aQ68FE2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg9aQ68FE2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atg9aQ68FE2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atg9aQ68FE2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atg9aQ68FE2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atg9aQ68FE2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atg9aQ68FE2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Atg9aQ68FE2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atg9aQ68FE2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atg9aQ68FE2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atg9aQ68FE2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms