Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Fnip1Q68FD7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fnip1Q68FD7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fnip1Q68FD7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fnip1Q68FD7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fnip1Q68FD7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms