Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nlrp9bQ66X22 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nlrp9bQ66X22 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nlrp9bQ66X22 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nlrp9bQ66X22 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nlrp9bQ66X22 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nlrp9bQ66X22 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlrp9bQ66X22 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlrp9bQ66X22 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlrp9bQ66X22 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlrp9bQ66X22 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms