Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Knl1Q66JQ7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Knl1Q66JQ7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Knl1Q66JQ7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Knl1Q66JQ7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Knl1Q66JQ7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Knl1Q66JQ7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Knl1Q66JQ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Knl1Q66JQ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Knl1Q66JQ7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Knl1Q66JQ7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Knl1Q66JQ7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Knl1Q66JQ7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Knl1Q66JQ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Knl1Q66JQ7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Knl1Q66JQ7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.39■■■□□ 2.93
Knl1Q66JQ7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Knl1Q66JQ7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Knl1Q66JQ7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Knl1Q66JQ7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Knl1Q66JQ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Knl1Q66JQ7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Knl1Q66JQ7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Knl1Q66JQ7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Knl1Q66JQ7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Knl1Q66JQ7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Knl1Q66JQ7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Knl1Q66JQ7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Knl1Q66JQ7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Knl1Q66JQ7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Knl1Q66JQ7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Knl1Q66JQ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Knl1Q66JQ7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Knl1Q66JQ7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Knl1Q66JQ7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Knl1Q66JQ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Knl1Q66JQ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Knl1Q66JQ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Knl1Q66JQ7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Knl1Q66JQ7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Knl1Q66JQ7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Knl1Q66JQ7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Knl1Q66JQ7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Knl1Q66JQ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Knl1Q66JQ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Knl1Q66JQ7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Knl1Q66JQ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Knl1Q66JQ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Knl1Q66JQ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Knl1Q66JQ7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Knl1Q66JQ7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Knl1Q66JQ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Knl1Q66JQ7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Knl1Q66JQ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Knl1Q66JQ7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Knl1Q66JQ7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Knl1Q66JQ7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Knl1Q66JQ7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Knl1Q66JQ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Knl1Q66JQ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Knl1Q66JQ7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Knl1Q66JQ7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Knl1Q66JQ7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Knl1Q66JQ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Knl1Q66JQ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Knl1Q66JQ7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Knl1Q66JQ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Knl1Q66JQ7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Knl1Q66JQ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Knl1Q66JQ7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Knl1Q66JQ7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Knl1Q66JQ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Knl1Q66JQ7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Knl1Q66JQ7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Knl1Q66JQ7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Knl1Q66JQ7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Knl1Q66JQ7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Knl1Q66JQ7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Knl1Q66JQ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Knl1Q66JQ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Knl1Q66JQ7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Knl1Q66JQ7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Knl1Q66JQ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Knl1Q66JQ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Knl1Q66JQ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Knl1Q66JQ7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Knl1Q66JQ7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Knl1Q66JQ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Knl1Q66JQ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Knl1Q66JQ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Knl1Q66JQ7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Knl1Q66JQ7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Knl1Q66JQ7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Knl1Q66JQ7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms