Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl12Q62401 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccl12Q62401 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.7 ms