Protein–RNA interactions for Protein: Q62351

Tfrc, Transferrin receptor protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfrcQ62351 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TfrcQ62351 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TfrcQ62351 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TfrcQ62351 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TfrcQ62351 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TfrcQ62351 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TfrcQ62351 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TfrcQ62351 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TfrcQ62351 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TfrcQ62351 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TfrcQ62351 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TfrcQ62351 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TfrcQ62351 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TfrcQ62351 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TfrcQ62351 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TfrcQ62351 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TfrcQ62351 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TfrcQ62351 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TfrcQ62351 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TfrcQ62351 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TfrcQ62351 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms