Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3a2Q62203 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3a2Q62203 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3a2Q62203 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms