Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprrQ62132 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprrQ62132 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprrQ62132 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprrQ62132 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprrQ62132 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms