Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MslnQ61468 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MslnQ61468 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MslnQ61468 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MslnQ61468 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MslnQ61468 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MslnQ61468 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MslnQ61468 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MslnQ61468 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MslnQ61468 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MslnQ61468 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MslnQ61468 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MslnQ61468 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MslnQ61468 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MslnQ61468 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MslnQ61468 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MslnQ61468 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MslnQ61468 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MslnQ61468 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MslnQ61468 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MslnQ61468 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MslnQ61468 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MslnQ61468 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MslnQ61468 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MslnQ61468 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MslnQ61468 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MslnQ61468 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms