Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NinQ61043 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NinQ61043 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NinQ61043 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NinQ61043 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NinQ61043 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NinQ61043 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NinQ61043 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NinQ61043 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NinQ61043 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NinQ61043 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NinQ61043 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NinQ61043 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NinQ61043 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NinQ61043 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NinQ61043 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NinQ61043 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NinQ61043 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NinQ61043 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NinQ61043 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NinQ61043 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NinQ61043 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NinQ61043 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NinQ61043 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NinQ61043 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NinQ61043 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NinQ61043 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NinQ61043 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NinQ61043 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NinQ61043 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NinQ61043 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NinQ61043 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NinQ61043 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NinQ61043 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NinQ61043 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NinQ61043 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NinQ61043 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NinQ61043 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NinQ61043 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NinQ61043 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NinQ61043 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NinQ61043 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NinQ61043 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NinQ61043 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NinQ61043 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NinQ61043 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NinQ61043 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NinQ61043 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NinQ61043 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NinQ61043 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NinQ61043 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NinQ61043 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NinQ61043 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NinQ61043 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NinQ61043 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NinQ61043 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NinQ61043 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NinQ61043 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NinQ61043 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NinQ61043 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NinQ61043 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NinQ61043 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NinQ61043 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NinQ61043 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NinQ61043 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NinQ61043 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NinQ61043 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NinQ61043 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NinQ61043 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NinQ61043 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NinQ61043 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NinQ61043 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NinQ61043 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NinQ61043 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NinQ61043 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NinQ61043 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NinQ61043 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NinQ61043 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NinQ61043 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NinQ61043 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NinQ61043 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NinQ61043 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NinQ61043 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NinQ61043 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NinQ61043 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NinQ61043 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NinQ61043 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NinQ61043 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NinQ61043 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NinQ61043 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NinQ61043 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NinQ61043 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NinQ61043 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NinQ61043 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NinQ61043 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NinQ61043 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NinQ61043 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NinQ61043 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NinQ61043 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NinQ61043 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms