Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Caprin1Q60865 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Caprin1Q60865 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms