Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfaip3Q60769 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfaip3Q60769 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfaip3Q60769 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfaip3Q60769 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfaip3Q60769 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfaip3Q60769 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfaip3Q60769 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfaip3Q60769 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfaip3Q60769 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfaip3Q60769 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfaip3Q60769 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfaip3Q60769 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfaip3Q60769 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfaip3Q60769 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfaip3Q60769 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfaip3Q60769 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfaip3Q60769 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfaip3Q60769 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tnfaip3Q60769 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfaip3Q60769 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfaip3Q60769 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfaip3Q60769 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfaip3Q60769 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfaip3Q60769 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfaip3Q60769 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfaip3Q60769 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfaip3Q60769 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfaip3Q60769 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfaip3Q60769 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfaip3Q60769 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfaip3Q60769 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfaip3Q60769 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfaip3Q60769 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms