Protein–RNA interactions for Protein: Q60595

Xlr3a, X-linked lymphocyte-regulated protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr3aQ60595 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Xlr3aQ60595 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Xlr3aQ60595 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xlr3aQ60595 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xlr3aQ60595 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xlr3aQ60595 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xlr3aQ60595 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xlr3aQ60595 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xlr3aQ60595 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xlr3aQ60595 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms