Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SynrgQ5SV85 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SynrgQ5SV85 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SynrgQ5SV85 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SynrgQ5SV85 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SynrgQ5SV85 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SynrgQ5SV85 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SynrgQ5SV85 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SynrgQ5SV85 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SynrgQ5SV85 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SynrgQ5SV85 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SynrgQ5SV85 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SynrgQ5SV85 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SynrgQ5SV85 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SynrgQ5SV85 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynrgQ5SV85 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynrgQ5SV85 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynrgQ5SV85 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SynrgQ5SV85 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SynrgQ5SV85 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SynrgQ5SV85 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SynrgQ5SV85 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SynrgQ5SV85 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SynrgQ5SV85 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SynrgQ5SV85 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SynrgQ5SV85 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SynrgQ5SV85 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SynrgQ5SV85 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SynrgQ5SV85 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SynrgQ5SV85 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SynrgQ5SV85 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SynrgQ5SV85 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SynrgQ5SV85 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SynrgQ5SV85 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SynrgQ5SV85 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SynrgQ5SV85 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SynrgQ5SV85 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SynrgQ5SV85 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SynrgQ5SV85 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynrgQ5SV85 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynrgQ5SV85 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynrgQ5SV85 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SynrgQ5SV85 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SynrgQ5SV85 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SynrgQ5SV85 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SynrgQ5SV85 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SynrgQ5SV85 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SynrgQ5SV85 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SynrgQ5SV85 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SynrgQ5SV85 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SynrgQ5SV85 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SynrgQ5SV85 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SynrgQ5SV85 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SynrgQ5SV85 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SynrgQ5SV85 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SynrgQ5SV85 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SynrgQ5SV85 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SynrgQ5SV85 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SynrgQ5SV85 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SynrgQ5SV85 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SynrgQ5SV85 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SynrgQ5SV85 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SynrgQ5SV85 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SynrgQ5SV85 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SynrgQ5SV85 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms