Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam46cQ5SSF7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam46cQ5SSF7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam46cQ5SSF7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam46cQ5SSF7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam46cQ5SSF7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam46cQ5SSF7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam46cQ5SSF7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam46cQ5SSF7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam46cQ5SSF7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam46cQ5SSF7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam46cQ5SSF7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam46cQ5SSF7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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