Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf12Q5SPL2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Phf12Q5SPL2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf12Q5SPL2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms