Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trdv4Q5R1A3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trdv4Q5R1A3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trdv4Q5R1A3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trdv4Q5R1A3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trdv4Q5R1A3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trdv4Q5R1A3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trdv4Q5R1A3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trdv4Q5R1A3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trdv4Q5R1A3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trdv4Q5R1A3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trdv4Q5R1A3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trdv4Q5R1A3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trdv4Q5R1A3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trdv4Q5R1A3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trdv4Q5R1A3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms