Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
1810065E05RikQ5NC41 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
1810065E05RikQ5NC41 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
1810065E05RikQ5NC41 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
1810065E05RikQ5NC41 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
1810065E05RikQ5NC41 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
1810065E05RikQ5NC41 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
1810065E05RikQ5NC41 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
1810065E05RikQ5NC41 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
1810065E05RikQ5NC41 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
1810065E05RikQ5NC41 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
1810065E05RikQ5NC41 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
1810065E05RikQ5NC41 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
1810065E05RikQ5NC41 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
1810065E05RikQ5NC41 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
1810065E05RikQ5NC41 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
1810065E05RikQ5NC41 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
1810065E05RikQ5NC41 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
1810065E05RikQ5NC41 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
1810065E05RikQ5NC41 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
1810065E05RikQ5NC41 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
1810065E05RikQ5NC41 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
1810065E05RikQ5NC41 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
1810065E05RikQ5NC41 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
1810065E05RikQ5NC41 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
1810065E05RikQ5NC41 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
1810065E05RikQ5NC41 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
1810065E05RikQ5NC41 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
1810065E05RikQ5NC41 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
1810065E05RikQ5NC41 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
1810065E05RikQ5NC41 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
1810065E05RikQ5NC41 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
1810065E05RikQ5NC41 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
1810065E05RikQ5NC41 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
1810065E05RikQ5NC41 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
1810065E05RikQ5NC41 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
1810065E05RikQ5NC41 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
1810065E05RikQ5NC41 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms