Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkaa1Q5EG47 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkaa1Q5EG47 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkaa1Q5EG47 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkaa1Q5EG47 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms