Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WhammQ571B6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WhammQ571B6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WhammQ571B6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WhammQ571B6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WhammQ571B6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WhammQ571B6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WhammQ571B6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WhammQ571B6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WhammQ571B6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WhammQ571B6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WhammQ571B6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WhammQ571B6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WhammQ571B6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
WhammQ571B6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WhammQ571B6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WhammQ571B6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
WhammQ571B6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WhammQ571B6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WhammQ571B6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WhammQ571B6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
WhammQ571B6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WhammQ571B6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WhammQ571B6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WhammQ571B6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms