Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhox3aQ4TU90 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhox3aQ4TU90 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhox3aQ4TU90 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox3aQ4TU90 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox3aQ4TU90 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox3aQ4TU90 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox3aQ4TU90 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhox3aQ4TU90 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhox3aQ4TU90 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhox3aQ4TU90 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhox3aQ4TU90 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhox3aQ4TU90 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhox3aQ4TU90 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhox3aQ4TU90 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms