Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDD4

Arap1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arap1Q4LDD4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Arap1Q4LDD4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Arap1Q4LDD4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Arap1Q4LDD4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Arap1Q4LDD4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Arap1Q4LDD4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Arap1Q4LDD4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Arap1Q4LDD4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Arap1Q4LDD4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Arap1Q4LDD4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Arap1Q4LDD4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Arap1Q4LDD4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Arap1Q4LDD4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Arap1Q4LDD4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Arap1Q4LDD4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Arap1Q4LDD4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Arap1Q4LDD4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Arap1Q4LDD4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Arap1Q4LDD4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Arap1Q4LDD4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Arap1Q4LDD4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Arap1Q4LDD4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Arap1Q4LDD4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Arap1Q4LDD4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Arap1Q4LDD4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Arap1Q4LDD4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Arap1Q4LDD4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Arap1Q4LDD4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Arap1Q4LDD4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Arap1Q4LDD4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Arap1Q4LDD4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Arap1Q4LDD4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Arap1Q4LDD4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Arap1Q4LDD4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Arap1Q4LDD4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Arap1Q4LDD4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Arap1Q4LDD4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Arap1Q4LDD4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Arap1Q4LDD4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Arap1Q4LDD4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Arap1Q4LDD4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Arap1Q4LDD4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Arap1Q4LDD4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Arap1Q4LDD4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Arap1Q4LDD4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Arap1Q4LDD4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Arap1Q4LDD4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Arap1Q4LDD4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Arap1Q4LDD4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Arap1Q4LDD4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Arap1Q4LDD4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Arap1Q4LDD4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Arap1Q4LDD4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Arap1Q4LDD4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Arap1Q4LDD4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Arap1Q4LDD4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Arap1Q4LDD4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Arap1Q4LDD4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Arap1Q4LDD4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Arap1Q4LDD4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Arap1Q4LDD4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Arap1Q4LDD4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138 ms