Protein–RNA interactions for Protein: Q4KUS1

Wfdc8, WAP four-disulfide core domain protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wfdc8Q4KUS1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wfdc8Q4KUS1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wfdc8Q4KUS1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Wfdc8Q4KUS1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wfdc8Q4KUS1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wfdc8Q4KUS1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wfdc8Q4KUS1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wfdc8Q4KUS1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wfdc8Q4KUS1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Wfdc8Q4KUS1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wfdc8Q4KUS1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wfdc8Q4KUS1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.2 ms