Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2al1nQ497L1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2al1nQ497L1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms