Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx25Q3ZT31 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx25Q3ZT31 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms