Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ckap2Q3V1H1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ckap2Q3V1H1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ckap2Q3V1H1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ckap2Q3V1H1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ckap2Q3V1H1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ckap2Q3V1H1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ckap2Q3V1H1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ckap2Q3V1H1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ckap2Q3V1H1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ckap2Q3V1H1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ckap2Q3V1H1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ckap2Q3V1H1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ckap2Q3V1H1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ckap2Q3V1H1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ckap2Q3V1H1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ckap2Q3V1H1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ckap2Q3V1H1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms