Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
4930567H17RikQ3V0K5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
4930567H17RikQ3V0K5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
4930567H17RikQ3V0K5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
4930567H17RikQ3V0K5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
4930567H17RikQ3V0K5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
4930567H17RikQ3V0K5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
4930567H17RikQ3V0K5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
4930567H17RikQ3V0K5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
4930567H17RikQ3V0K5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
4930567H17RikQ3V0K5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
4930567H17RikQ3V0K5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
4930567H17RikQ3V0K5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
4930567H17RikQ3V0K5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
4930567H17RikQ3V0K5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms