Protein–RNA interactions for Protein: Q3V096

Ankrd42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd42Q3V096 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms