Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bbof1Q3V079 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bbof1Q3V079 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bbof1Q3V079 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms