Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ57

Axdnd1, Axonemal dynein light chain domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Axdnd1Q3UZ57 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Axdnd1Q3UZ57 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Axdnd1Q3UZ57 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Axdnd1Q3UZ57 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms