Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mbd3l2Q3UXB0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms