Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Capn13Q3UW68 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Capn13Q3UW68 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Capn13Q3UW68 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Capn13Q3UW68 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Capn13Q3UW68 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Capn13Q3UW68 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Capn13Q3UW68 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms