Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BB287469Q3UT53 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BB287469Q3UT53 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms