Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sec31aQ3UPL0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec31aQ3UPL0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec31aQ3UPL0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sec31aQ3UPL0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
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