Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc33Q3ULW6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc33Q3ULW6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc33Q3ULW6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc33Q3ULW6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc33Q3ULW6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc33Q3ULW6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc33Q3ULW6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc33Q3ULW6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc33Q3ULW6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc33Q3ULW6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc33Q3ULW6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc33Q3ULW6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc33Q3ULW6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc33Q3ULW6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc33Q3ULW6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc33Q3ULW6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc33Q3ULW6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc33Q3ULW6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc33Q3ULW6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc33Q3ULW6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc33Q3ULW6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc33Q3ULW6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc33Q3ULW6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc33Q3ULW6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc33Q3ULW6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc33Q3ULW6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc33Q3ULW6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc33Q3ULW6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc33Q3ULW6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc33Q3ULW6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc33Q3ULW6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc33Q3ULW6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms