Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Zswim8Q3UHH1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Zswim8Q3UHH1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zswim8Q3UHH1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zswim8Q3UHH1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zswim8Q3UHH1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zswim8Q3UHH1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zswim8Q3UHH1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zswim8Q3UHH1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zswim8Q3UHH1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zswim8Q3UHH1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zswim8Q3UHH1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zswim8Q3UHH1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zswim8Q3UHH1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zswim8Q3UHH1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zswim8Q3UHH1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zswim8Q3UHH1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zswim8Q3UHH1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zswim8Q3UHH1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Zswim8Q3UHH1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Zswim8Q3UHH1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Zswim8Q3UHH1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zswim8Q3UHH1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zswim8Q3UHH1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zswim8Q3UHH1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms