Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgef1Q3UHC1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rapgef1Q3UHC1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rapgef1Q3UHC1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rapgef1Q3UHC1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rapgef1Q3UHC1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rapgef1Q3UHC1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rapgef1Q3UHC1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rapgef1Q3UHC1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rapgef1Q3UHC1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms