Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3U6N9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3U6N9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3U6N9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3U6N9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3U6N9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3U6N9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3U6N9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3U6N9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3U6N9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3U6N9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3U6N9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3U6N9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Q3U6N9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms