Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc10Q3TLI0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc10Q3TLI0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc10Q3TLI0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trappc10Q3TLI0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc10Q3TLI0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trappc10Q3TLI0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.8 ms