Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nlrp1aQ2LKU9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nlrp1aQ2LKU9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlrp1aQ2LKU9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlrp1aQ2LKU9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlrp1aQ2LKU9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nlrp1aQ2LKU9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms