Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptcd3Q14C51 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ptcd3Q14C51 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptcd3Q14C51 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptcd3Q14C51 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptcd3Q14C51 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms