Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tigd2Q0VBL1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tigd2Q0VBL1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tigd2Q0VBL1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tigd2Q0VBL1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tigd2Q0VBL1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tigd2Q0VBL1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tigd2Q0VBL1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tigd2Q0VBL1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tigd2Q0VBL1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tigd2Q0VBL1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tigd2Q0VBL1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms