Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp2Q08652 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp2Q08652 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp2Q08652 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp2Q08652 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp2Q08652 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp2Q08652 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbp2Q08652 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.2 ms