Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gdf3Q07104 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gdf3Q07104 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gdf3Q07104 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms