Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scg2Q03517 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scg2Q03517 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scg2Q03517 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scg2Q03517 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scg2Q03517 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scg2Q03517 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scg2Q03517 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scg2Q03517 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms