Protein–RNA interactions for Protein: P97798

Neo1, Neogenin, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neo1P97798 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Neo1P97798 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Neo1P97798 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Neo1P97798 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Neo1P97798 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Neo1P97798 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Neo1P97798 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Neo1P97798 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Neo1P97798 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Neo1P97798 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Neo1P97798 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Neo1P97798 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Neo1P97798 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Neo1P97798 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Neo1P97798 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Neo1P97798 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Neo1P97798 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Neo1P97798 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Neo1P97798 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Neo1P97798 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Neo1P97798 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Neo1P97798 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Neo1P97798 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Neo1P97798 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Neo1P97798 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Neo1P97798 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Neo1P97798 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Neo1P97798 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Neo1P97798 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Neo1P97798 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Neo1P97798 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Neo1P97798 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Neo1P97798 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Neo1P97798 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms